Al parecer básicamente ImageMagick sólo funciona bajo línea de comandos, lo que he utilizado para crear thumbs es el siguiente código
Código PHP:
//AUTODETECCIÓN Y SUPONIENDO PATH A IMAGEMAGICK = ''
$cmd = "convert -resize ".$ancho."x".$alto." ".$im_entrada." ".$im_salida;
@exec($cmd);
Espero que ayude en algo!