yo hago algo como esto:
Código PHP:
do{
echo "<td bgcolor=\"$color\" align='center'><font color='#000000'><input type = \"checkbox\" name=\"existe[]\" value =\"$row[id]\"></font></td>";
} while($row=mysql_fetch_array($result));
y en otro script paso los registros:
Código PHP:
for ($i=0;$i<=count($existe);$i++){
if (isset($existe[$i])){
update //actualizar tus registros
}
}
espero te sirva