Plesk corre sobre mysql y php5. Los sitios web que actives utilizarán php4. En los servidores con plesk por defecto tendrás por tanto php5 (para el panel de control plesk), php4 (para los sitios web) y Mysql (creo que lo último es MySQL 4.1).
Elmotor MySQL es común tanto para el panel de control plesk como para las bases de datos de los clientes que alojes.
Plesk NO soporta MySQL5. Si actualizas a MySQL5 plesk dejará de funcionar.
Para utilizar php5 puedes hacer dos cosas:
1.- modificar el php.conf de /etc/httpd/conf.d para que utilice el php5 del panel de control plesk
2.- Compilar php5 para que substituya el php4
3.- Recomendable: actualizar php4 a php5 con
www.atomicrocketturtle.com
Para más detalles e información específica te recomiendo muy encarecidamente que visites el foro de swsoft.com y el foro de atomic.