como dar privilegios de root

[Ace_ventura]

Es nuestro proyecto de grado, es una aplicacion java, hecha en jsp, ya existe el correo de la universidad donde yo estudio pero esta hecho en perl y cgi, la idea es migrarlo hacia java con tecnologias jsp y xml, ya tenemos hecho la parte del cliente que es la que puede ejecutar cualquier estudiante que se conecte a internet accediendo a su buzon de correo desde la pagina principal de la universidad x medio de un vinculo, tenemos tambien que hacer un modulo administrador que es para el administrador poder crear las cuentas de usuario, asignar clave, borrar un usuario y darle permiso a un usuario de manejar listas de correo, la aplicacion va estar en un servidor unicamente para eso (dedicado), el administrador quiere utilizar qmail para el manejo del correo, nosotros desde la aplicacion cliente el usuario puede cambiar su clave periodicamente x cuestiones de seguridad, x eso es que pregunto como hacer para que pueda ir y modificar el archivo donde estan las claves guardadas en el sistema en /etc/passwd, ya que el usuario no tiene privilegios de root para poder modificar archivos a travez de la aplicacion, xq sino imaginate el agujero para la seguridad del servidor. Y como la aplicacion es en java y el servidor va estar montado bien sea sobre linux o solaris.