Si no he entendido mal la cuestión, en realidad esto se soluciona de la manera que ya se ha comentado muchas veces aquí:
hacer una clase que produzca el corte
.corte {clear:both;}
y justo después del div que estás dentro, antes de cerrar el contenedor, poner:
<div class="corte"></div>
Me pareció que era esta la cuetión que planteaba, pero igual estoy equivocado.
Mikel.