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Iniciado por caricatos 
Hola:
Según veo los nombres que se generan son: cod_anexo[1]...cod_anexo[4]...
La solución sería:
form["cod_anexo[1]"].disabled = false;
form["cod_anexo[2]"].disabled = false;
...
En javascript no se considera un array salvo que tengan un nombre igual y los corchetes que sirven en php no te valen para ese cometido...
Saludos
Tengo una duda.....con el mismo código php que generé los checkbox, he generado cuadros tipo file:
<?php
<input type='file' name='anexo[]' size='38' class='buttonFile' disabled>
?>
mi pregunta es como manejo esto desde javascript???......intento hacer lo mismo que con los checkboxes y me sale error.....por favor ayuda