Si magic_quotes_gpc esta en off entonces proba de hacer un
Código PHP:
echo 'algo con " y mas " y tal vez simples \' ';
a ver si ahí también te las escapa.
Si es eso, y no tenés acceso al php.ini podes usarte
esta función.
En los input hay cambios según el OS, pero con las " no lo conozco; por eso mismo remarco que tengas bien en cuenta que no es lo anterior, cosa que no me respondes si probaste ( no te trato de idiota, solo que no veo que lo hayas afirmado).