Realmente con ésto ya me ha quedado clarísimo, he probado ésta última forma y también me ha funcionado =)
Por ahora utilizaré la de 2 archivos css diferentes (cuerpo.css y cuerpo-ie.css) por el hecho de que necesito establecer otros estilos mediante las etiquetas <style></style>, concretamente para imágenes, que se comportarán de forma distinta en cada página... con lo que ya no podría introducir todo el <style> en el comentario condicional de IE.
Lo dicho, me has resuelto el problema, muchas muchas gracias
Saludos!