En After Effects puedes hacer lo que te venga a la imaginación... Si has usado Photoshop es algo parecido pero con todo el poder del video, así que las transiciones entre capas también aplican y puedes darles los niveles de intensidad que desees, con los cortes que necesites
Si no sabes nada del After, avísame y te mando un vtuto en español. (40 minutos para aprender a usarlo
)