1) el archivo principal de configuración es /etc/apache2/apache2.conf, y este archivo no debes modificarlo, porque es sobreescrito cada vez que actualizas el Apache 2.
Las modificaciones que quieras hacer para los sitios web las haces en los archivos que estén en /etc/apache2/sites-available/, que ya de por sí existe el archivo /etc/apache2/sites-available/default. Puedes crear un archivo de configuración nuevo basado en este
como /etc/apache2/sites-available/misitio, debes luego crear un enlace en el directorio /etc/apache2/sites-enabled/ y borrar el enlace que ya existe previamente al sitio 'default' así:
Código:
ln -s ../sites-available/misitio /etc/apache2/sites-enabled/000-misitio
rm /etc/apache2/sites-enabled/*default
2) si, sigue siendo /etc/host
3) Ah y si puedes borrar el /etc/apache antiguo.
Saludos