No sé si esto resuelva tu inquietud, pero en cPanel, en este caso, si quieres tener acceso FTP para ese subdominio, el nombre de usuario de esa cuenta FTP tiene que ser el mismo nombre del subdominio.
Si el subdominio es "cliente" entonces el nombre de usuario FTP tendrá que ser "cliente" también.
Y luego (siguiendo el ejemplo), cuando vas a acceder por FTP a ese subdominio, en el nombre de usuario debes poner "
[email protected]".
Saludos.