Hola:
Un tag javascript lo puedes poner perfectamente en el cuerpo de tu página, y puedes usar las funciones inmediatamente después de declararlas...
Pero si vas a referenciar algo, debes estar seguro de que existe.
Código:
<form action="" method="get" name="f">
<select name="s">
<option value="1">valor 1</option>
<option value="2">valor 2</option>
<option value="3">valor 3</option>
<option value="4">valor 4</option>
</select>
</form>
<script>
document.forms.f.s.value = "3";
</script>
Saludos