Lo mejor es hacer carpetas dentro del OE 6 y poner los archivos viejos ahi (ojo la carpeta fuera de la bandeja de entrada) dejando la Bandeja limpia, luego empacar dichas carpetas.
Si sigue dando fallos debes irte a "Inicio" ==> "Ejecutar".... ahi escribe "sfc /scannow" (sin las comillas) y te reparará el OE6 y el IE ya que ocupan las mismas librerías.