Código PHP:
$ver = mysql_query("SELECT campo FROM tabla");
mysql_select_db("base");
$row = mysql_fetch_array($ver);
if($row[0]=="si"){
$checado="1";
}else{
$checado="no";
}
<input type="checkbox" value="algo" <? if($checado=="1"){ echo "checked='checked'"; } else { echo ""; }?>>
No sé si es lo que buscas, pruebalo. Saludos