Cita: bueno, conseguí que el .htaccess funcionara bajo windows, configurando el http.conf para la carpeta donde va a ir colocado ese fichero ...
Dime cómo lo hiciste que me interesa mucho
Respecto a tu problema, tienes que poner los enlaces de la forma:
<a href="../portada"> ...</a>
<a href="../comentarios">...</a>
Creo que también funcionaría si pones la etiqueta <base> en el código fuente
<base href="http://localhost/aplicacion/">
Saludos
