Si vas a migrar una aplicacion de Winform VS2003 a Winforms VS2005 debes tener en cuenta que las librerias que uses si sean compactibles con Framework 2.0,. por ejemplo el Enterprise Library de 2003 tendrias problemas con VS2005, por otro lado si solo lo usas para aprender y no usas controles raros o librerias raras no tendrias problemas, cuando intentes abrir el proyecto en VS2005 automaticamente se ejecuta un asistente de conversion y te informara los problemas o errores que ocurran durante el proceso
Saludos