Hola:
Las alertas las creas con el método alert(info)... donde se nuestra la info que quieras y automáticamente el navegador crea el botón de aceptar que al pulsarlo cierra esa ventana... sobre las ventanas popup puedes encontrar información en las FAQs de javascript...
Haz una búsqueda y si tienes problemas nos avisas.
Saludos
