Debería funcionarte. De última, modificá tu código por este (incluye modificación del tipo del botón, la llamada con onsubmit y prescinde del include js):
Código:
<html>
<HEAD>
<LINK REL="stylesheet" HREF="includes/estil_gen.css" TYPE="text/css">
</HEAD>
<BODY CLASS="fondo">
<FORM METHOD="post" ACTION="presup2.php" NAME="recordar" onSubmit="control=email.value.length==0 ;if(control)alert('debe completar el email'); return !control;">
<P>Introduzca el correo electrónico con el que se registró:</P><P><INPUT TYPE="text" NAME="email" SIZE=40></P>
<INPUT name="Enviar" TYPE="submit" VALUE="Enviar">
</FORM>
</BODY>
</html>