mmm esta muy interesante tu diseño
, me agrada.. mas interesante sería si lo haces en CSS (de todas formas no se te resuelve el problema de IE6).
No puedo aconsejarte mucho porque de tablas ahora entiendo poco y nada a la hora de resolver estos problemas, pero fijate si necesitas anidar alguna tabla mas en alguna parte, quizas sea eso.
Saludos!