A ver empezado por ahí .. nunca comentastes que usas una estructura "modular".
En una estructura "modular" .. en lugar de guiarte por el nombre de tu página (que siempre será "index.php") debes guiarte por esa variable de control que tu usas para identificar tu sección.
Código PHP:
if ($_GET['sec'] == "inicio"){
Un saludo,