Es otro de los caprichos del IE. La solución (o más bien parche) consiste en instanciar un iframe como último elemento de nuestro documento (o al menos luego de los selects) y posicionarlo en el mismo lugar que tu div.
Aquí tienes un pequeño artículo que explica las causas del problema y la solución mediante un ejemplo:
http://weblogs.asp.net/bleroy/archiv...09/422047.aspx
Saludos.