Que tal Mary.
 
Espero que le haya entendido a tu problema porque como que son muchas preguntas pero no muy concretas. 
Tu problema es que quieres eliminar los registros de una tabla ( llamemos  
tabla1) del día anterior y guardar el último registro también del día anterior. 
Me refiero al día anterior porque el proceso al menos se tardará un segundo, ya que eliminar 86,400 (60X60X24) registros generados en un día no creo que lo haga en menos tiempo. 
Para esto te recomiendo, que tabla1 tenga un campo 
Identity al que llamaremos 
IdRow, el cual nos ayudará a identificar el último registro del día. 
La 
tabla2 de igual estructura que 
tabla1 tiene los últimos registros de todos los días. 
Solo nos basamos en la fecha para no considerar la hora, de esta forma se consideran desde las 0 hrs hasta las 23:59:59. Para esto usamos la funcion CONVERT . 
Necesitamos crear el siguiente SP, el cual realiza las tareas mencionadas.  
Código:
 CREATE PROC dbo.Sp_ProcesoDiario
AS
BEGIN
	DECLARE @lintUltimoRegistro int
	DECLARE @ldtFechaDiaAnterior datetime
	SET @ldtFechaDiaAnterior  = dateadd ( d, -1 , getdate() )
	-- Estoy supondiendo que tu tabla deba de tener in Campo Identity, es muy necesario.
		-- El campo se llama IdRow
	
	--Obtenemos el IdRow del último registro del día anterior. LAS fECHAS LAS MANEJAMOS EN YYYYMMDD
	SELECT @lintUltimoRegistro = Max(IdRow)	
	From tabla1 
	WHERE CONVERT (char(10), getdate() , 112) = CONVERT (char(10), @ldtFechaDiaAnterior , 112)
	-- Guadar último registro del día anterior. Tabla 1 tabla2 tienen la misma estructura.
	INSERT INTO tabla2 
	SELECT * FROM tabla1 
	WHERE IdRow = @lintUltimoRegistro 
	--Finalmente borramos el resto de registros (del día anterior) de Tabla1.
	DELETE FROM Tabla1 WHERE CONVERT (char(10), getdate() , 112) = CONVERT (char(10), @ldtFechaDiaAnterior , 112)
END
  Ahora bien, el SP anterior lo tenemos que ejecutar todos los días a las 00:00:00, para esto hacemos lo siguiente(crearemos un 
Job): 
En el 
Enterprice Manager de SQL Server en la seccion de 
Administración y finalmente 
Trabajos(job), creamos uno 
Nuevo. 
En la ficha 
General:	
Nombre. Dar algun nombre de Id. 
Propietario. Se recomienda que tenga rol de administrador. 
En la ficha 
Pasos: Dar click en 
Nuevo.
			Dar el 
Nombre del Paso.
			En 
Tipo seleccionar Secuencia de Comando TRansact-SQL 
Seleccionar la BD's.
			En el campo 
Comando, escribir lo siguiente: 
EXEC dbo.Sp_ProcesoDiario
			Y dar click en 
Aceptar.
En la Ficha 
Programaciones:	
   Dar click en 
Nueva programación.
      Dar el 
Nombre.
      Seleccionar 
Periódica.
      Seleccionar 
Cambiar.
         Seleccionar 
Sucede Diariamente.
         Seleccionar 
Cada 1 Dias.
         Sucede una vez a las 
12:00:00 am
         Dar click en 
Aceptar.
      Dar click en 
Aceptar.
   Dar click en 
Aceptar. 
----------------------
Espero que te sirva todo esto. 
Saludos. 
P.D. Mi SQL server esta en español, espero que el tuyo también para que sea un poco más fácil.