Mira alguna vez tuve el mismo problema, y Cluster mi dio una solucion la cual no recuerdo como era... pero lo que si se es que hice lo siguiente:
Cuando abres el popup le pasas la variable de sesion por metogo GET... por ejemplo con un link
< a href ="<aca debera ir tu codigo javascript>?session_id=$echo tusesion
entonces en la pagina en la que verificas la sesion, en vez de ver el status, simplementes haces lo siguiente
if (!empty($_GET['session_id'])){
echo "El usuario es valido";
}else{
echo "El usuario es invalido";
}
ejjeej es un metodo un poco artesanal, pero me sirve...+
Saludos