Seguro que estas indicando mal la ruta.
Prueba con lo siguiente, si la web la guardas digamos en la carpeta WEB, crea una subcarpeta que se llame ADMIN, de esta forma te queda /WEB/ADMIN
Pon el archivo conexion.php (en el cual tienes la Base conexión a la Base de Datos) dentro de admin y luego en los archivos haces el include.
Código PHP:
include("./../conexion.php")
El .. baja un nivel el directorio y el . te coloca en el directorio activo.