Gracias a todos, ya está resuelto
Al final me grabé varios disquetes uno con cada cosa, si uno no funciona será el otro

Pero no hizo falta usarlos, al arrancar la bios ya detectaba los discos y estaba en modo IDE, asi que al instalar windows no pulsé el F6, siguió con la instalación y me mostró sin problemas los dos discos... la instalación bien también, reconoció bien la capacidad (250 GB) de ambos

La pega es que windows se me instaló en la unidad I: y no en C: y lo peor es que no me deja cambiarla desde el administrar mi pc, asi que hoy formateo y lo vuelvo a instalar a ver qué pasa...
Saludos