Hola de nuevo maria_aa,
Bueno, respecto a las versiones lo que está claro cuando hay una versión nueva siempre es una mejora de la versión anterior que incluye los arreglos de los fallos (bugs) y nuevas funcionalidades. Pero también tienes que saber que versión vas a aplicar dependiendo de la página que quieras diseñar, sobre todo las versiones de PHP (páginas dinámicas). Lo de instalar una versión nueva encima de una antigua, teoricamente no daría problemas (por si en un futuro quieres instalar la versión anterior, tendrías que desinstalar la versión nueva) pero te recomendaría que hagas una copia del archivo de configuración (php.ini) por si las moscas...
Espero haberte ayudado de algo,
Un besazo