Lo que hacen esos 3 comandos es:
./configure: detecta si tenés todas las bibliotecas, programas y versiones de los mismos como para compilar correctamente el programa. Si pasa sin errores, lo más seguro es que el programa se compile y funcione.
make: compila. A veces surgen errores en este paso, pero si va bien, podés estar seguro al 100% de que el programa va a funcionar.
make install: "instala", es decir, copia en las carpetas correspondientes todos los archivos que el programa necesita. En este paso es muy difícil que se produzcan errores (puede surgir un error si no lo ejecutás con permisos de root, ya que no tendría los permisos como para escribir en las carpetas), ya que lo único que hace es copiar archivos.
Para ejecutar el programa:
simplemente escribí el nombre del programa en la línea de comandos. Algunos programas se agregan a los menúes de kde o gnome, pero no todos.
¿cómo saber el nombre? lo más seguro es que tenga el mismo nombre que la carpeta del código fuente, sin la información de versión.
Lo más común es que la compilación genere un ejecutable (al hacer un ls lo verás seguramente en verde o con un * junto al nombre) en la carpeta del código fuente o en la subcarpeta src, si existe.
Si no es el caso, preguntá de nuevo.
Saludos y suerte con Linux, seguro que en cuanto lo configures completamente no te despegás más
