Si, tiene pinta de sectores dañados, si son físicos estaria bien descubrir el espacio perdido, a partir de aqui separar este espacio y comenzar 1 Mb mas adelante del daño, esto si se confirma que es físico.
Chkdsk es una de las mejores herramientas de Windows y con el se reparan errores que en ocasiones son graves. Existen programas para comprobar el estado físico del disco, en ocasiones si no son muy graves se recuperan muchos sectores y ganas espacio,
aquí tienes HDD Regenerator que parece ser cumple bien con sus funciones que son las que te he comentado.
Eso si, siempre, siempre...siempre, backup de los datos ANTES de tocar nada relacionado con el SO y el disco duro, eso hará que quedes mas tranquilo en caso de que algo falle.
Suerte y un saludo.