Bueno, encontré un programilla para los que se "peleen" con Acrobat Reader.
Este programa promete sencilles de uso, tanto que no requiere ni instalación y permite guardar el PDF en distintos formatos, incluyendo el TXT.
Si ayuda a aclarar dudas y a que podais manipular el texto, mejor que mejor
.
http://cool-pdf-reader.uptodown.com/
Un saludo y ya direis que tal funciona.