Intenta cambiando tu código de esta manera:
Código PHP:
<?php
include ('conexion2.php'); // supongo que aquí tienes los datos de conexion y seleccion de bd
$sql= "SELECT * FROM total_dias WHERE rut='".$rut."'";
$res = mysql_query ( $sql );
$num_res = mysql_num_rows( $sql ); // con esto sabras si la $rut ya existe
if ( $num_res > 0 ) // si existe rut
{
$sql2 = "UPDATE total_dias SET rut='".$rut."', total_rojos='".$total_rojos."', ";
$sql2 .= "total_embarcado='".$total_embarcado."' WHERE rut='".$rut."'";
mysql_query ( $sql2 );
echo "Registro Actualizado";
}
else // si no existe rut
{ // tambien supongo que las variables $rut, $total_rojos y $total_embarcado fueron definidas anteriormente
$sql3 = "INSERT INTO total_dias (rut, total_rojos, total_embarcado) ";
$sql3 .= "VALUES ('".$rut."', '".$total_rojos."', '".$total_embarcado."')";
mysql_query ( $sql3 );
echo "Registro Añadido";
}
?>
Espero te haya servido de algo, por lo menos para darte una idea. Suerte