Hola:
Si ese dato es un array, se puede convertir en una cadena con sus elementos separados por comas bastaría con usar el método join:
destino = un_array.join(",")...
Para que la comunicación sea desde un popup, en vez de window en el mensaje de monoswim (¡Hola Esteban
!) debes usar opener.
Particularmente no usaría un enlace (etiqueta a) para ejecutar un script... creo que son mejores los botones e incluso cualquier elemento y su evento click (onclick)... lo digo por el ejemplo de monoswim.
Saludos
