Tengo entendido que a excepción de Fast/alltheweb, ningún buscador puede indexar sites en flash. Los spiders leen textos e ignoran las imágenes. Aunque se tambien que Google ha empezado a indexar Flash, pero no lee el contenido. En general es recomendable utilizar Flash sólo para publicidad o resaltar algún contenido. (Recomendacion de nuestra amiga SilviaS)

... Sin embargo, existía una solucion PAGADA que decían si poder posicionar sites en flash con excelentes resultados. Los amigos de "LOCALIZARTE", no los he usado, y como toda rareza es cara, pero si te animas a usarlo, me comentas.
www.localizarte.com/flash.php
Por alguna razón han salido de Internet, por algo será, pero te puede dar una luz...busca en el cache de google.