Hola:
Si te posicionas por medio de anclas, éstas quedan reflejadas en la url de forma tuweb#el_ancla... entonces podrías ir a la posición (supongo) llamando a la url...
opener.location.href = opener.location.href;
Si no usas anclas es mucho más complicado, porque tendrías que registrar el scroll de la página antes de hacer el refresco, y restaurarlo después...
Saludos
