Hola capo di tutti capi (bonito avatar).
Las onboard de Intel han aumentado bastante de rendimiento, ahí mismo ves que ya soportan DX9 por hardware y Shaders 3.
El que tanto ralentizan el sistema depende de cuanto sea lo que configures de VRAM y cuanto sea lo que pongas como RAM total. No es lo mismo 384MB totales con 256MB compartidos para video; que 1GB totales con 128MB compartidos
Mi recomendación es que uses la onboard y compres 1GB de RAM. Configura la tarjeta onboard a 128MB y usala un tiempo así. Después cambia a 256MB compartidos y ve si notas una mejora de desempeño, si no lo hay regresa a 128 para aprovechar esa RAM dentro del sistema principal.
La tarjeta independiente dejala para cuando veas que la onboard con 256MB no te satisface... o para cuando quieras instalar windows vista