En principio y con PHP directamente no puedes por un tema de permisos de acceso a los archivos que el "cron job" maneja internamente y que tampoco están en lo que tu ves en tu cuenta entrando por "FTP" (son archivos de sistema).
Lo que si que puedes hacer ya que comentas que usas cPanel es "disparar" desde PHP la ejecución de los scripts (Perl/CGI) de cPanel para dicha taréa.
Un ejemplo que te puede ilustrar:
http://www.omidsoft.com/tutorial/cre...ox_cpanel.html
Ahí crean una cuenta de e-mail .. pero bajo la misma filosofía podrías atacar otros módulos de cPanel.
Un saludo,