Los mejores son los de McGraw Hill que los encuentras en las librerias, eso si, depende en si, a que programa te refieras, recuerda que paquetes ofimaticos tenemos por ejemplo, Office y OpenOffice... otra buena linea de manuales son los "[nombre de programa] para Dummies", manuales online puedes buscarlos en la red, como en
www.lawebdelprogramador.com