Si no especificas nada más sobre las condiciones de tu "conexión" .. sólo te puedo remitir al manual oficial de PHP:
www.php.net/mssql www.php.net/odbc
Podrías conectarte por ODBC o por funciones nativas MSSQL.
Debes especificar que Sistema Operativo usa el servidor que corre PHP, si están en la misma máquina junto con SQL Server o en otra .. Todo esto para escojer la mejor opción. Especifica si tienes acceso a la configuración del servidor (por si hay que instalar algo).
Un saludo,