haber si entendí. Las ligas que según tú no funcionan son:
Código PHP:
<p class="Estilo1"> MENU
<p class="Estilo13 Estilo18"><a href="mostrar.php" target="_top">Mostrar</a>
<p class="Estilo20"><a href="borrar.php" target="_top">Borrar</a></p>
<p class="Estilo18"><a href="index.php" target="_top">Inicio</a></p></td>
?
Yp he probado tu código en mi máquina y si creo los archivos mostrar.php, borrar.php e index.php en el directorio de raíz me van bien. No sé cual siga siendo el problema.