Código PHP:
$array = array( 'a', 'b', 'c', 'd' );
$toJavaScript = implode( ';', $array );
De alguna forma pasa el $toJavaScript a tu script a lo mejor asi:
Código:
var raw = '<?php echo $toJavaScript; ?>';
var theArray = raw.split( ';' );
ya en theArray tienes el array que tenias en javascript.