Prueba hacer lo siguiente, primero respalda todos los datos en CDs o mejor en DVDs y vas eliminando esos archivos del sistema , luego de terminar con dichos respaldos hechos de la forma tradicional, con por ej. el Nero Express, procedes a realizar una imágen del sistema con por ejemplo el Norton Ghost o similares , luego instala todos los programas en el nuevo equipo, concluido esto, procede a reemplazar las carpetas situadas en "C\rchivos de Programas" , C\ Document and Setting\Usuario\Datos de programas" y en" C\Archivos de Programas\Archivos Comunes" terminado esto, la mayoría de las configuraciones serán transplantadas de un equipo a otro y para haer eso tendrás que valerte del "Ghost Explorer", solo queda reponer los archivos guardados en CDs o DVDs durante el primer paso, aprovecha de hacerlo en otra partición.
Otra posibilidad que nunca probé, es usando software de virtualización, por ejemplo el "VM WARE", supuestamente puedes correr todo un equipo en otro
http://www.vmware.com/products/server/