Carpeta con archivos incompletos

[miglos]

Saludos!
Bueno, el problema es ese, al acceder mediante WS_FTP Pro a mi directorio de imagenes, aparecen menos imagenes de las que tengo guardadas (1998 de un total de 2582), sin embargo cuando entro por la ruta de mi navegador a ese directorio, se ve el listado y aparecen los 2582 archivos.
Lo mismo sucede cuando lo hago via el cpanel, administrador de archivos.
Alguna idea de porque pasa esto???