Hola Fabuazul, si deseas puedes pegar tu log de Hijackthis aquí mismo para analizarlo.
Para reparar el IE te recomiendo descargar y ejecutar el
IEFix
Si el problema persiste entonces ve a Inicio-->Ejecutar y escribe
sfc /scannow y clic en Aceptar, todo esto con el CD de instalación de Windows puesto.
Reinicia la máquina y verifica los resultados.
Ya nos contarás como te fue.
Saludos