Cita: El problema no es crear el PDF, sino cómo puedo guardar los resultados temorariamente en la web para que el la ultima etapa se pueda unir todo el análisis distribuido en las tres etapas (tres documentos php).
Usa una sesión.
www.php.net/session
De tu formulario 1 -> a proceso1.php .. toma los datos que recibies y los dejas en una variable de sesión .. así con todos los procesos .. En tu último proceso toma todos los datos de tu sesión creada y genera tu PDF.
Un saludo,