Hola,
No sé si esta información te sirva, pero quizás podrías crear al menos un par de carpetas y jugar un poco con combinaciones de permisos.
Por ejemplo, a un directorio al cual vas a subir archivos, le puedes poner permisos 743
Y si quieres un directorio desde el cual solamente se puedan descargar archivos, entonces le puedes poner permisos 745
Las posibles combinaciones están en tus manos.
Saludos.