Yo creo que puedes tener dos hojas de estilo tranquilamente linkadas. Haces dos hojas diferentes con diferentes nombres.
En cada una de ellas pones los nombres a los selectores que quieras siempre que sean diferentes. Esto es que no se repitan los nombres de los selectores entre las dos hojas.
El resto es divear correctamente el HTML de forma que distribuyas los divs segun quieras para las partes de la página.
Y creo que no hay mas....
Claro que nunca se sabe...