Lo que yo hice una vez, es primero creas la tabla con tus 5 campos + tu id autonumerico, luego con tu base de datos exportada en un formato por decir CSV, usas algo como PHPMyAdmin para importarlo, pero le dices que solo lo inserte a tus 5 campos, eso les genera un id a cada uno, y lo autoincrementa.
Espero te sirva
