creo q entendi bien, tienes un swf en una carpeta, y quieres acceder a ella desde otras paginas que estan en otras carpetas, para solucionarlo sin mas inconvenientes solo cambia la url del swf en cada una de tus paginas html que lo soliciten pon la url completa
http://www.tusitio.com/logo/juegos....swf
yo hago eso, para no dar mas vueltas.
Saludos