Lo más cómodo es pasarlo a String y leer de cada posición.
Código PHP:
int numero = 563;
String cadena = String.valueOf(numero);
...
array[0]=Integer.parseInt(cadena.charAt(0).toString());
array[1]=Integer.parseInt(cadena.charAt(1).toString());
array[2]=Integer.parseInt(cadena.charAt(2).toString());
....