puedes subir todos lor archivos al directorio en tu servidor, una vez ahi hacer un script en php para renombrarlos y en insertarlos en la base de datos.
Algo similar a esto.
Código PHP:
if($handle = opendir($carpeta))
{
while (false !== ($file = readdir($handle)))
{
$files[] = $file;
}
sort($files);
$cont=1;
foreach ($files as $nombre)
{
$nombre2="AB".$cont;
if ($nombre != "." && $nombre != "..") {
mysql_query("insert into db values ('$nombre2')", $dbi);
$cont++;
echo "<br>".$nombre;
rename($nombre,$nombre2);
}
}
}
Cita: No se si funcione lo copie de otro post y lo modifique un poco pero es la idea.