OK, voy a mover tu mensaje a la sección donde pueden ayudarte más y te respondo un poco.
Primero instala el windows que necesites en la partición primario y solo crea la partición secundaria sin formatearla.
Segundo, no hay versiones de Linux, existen DISTRIBUCIONES que es diferente y depende de tus conocimientos o necesidades, existen muchas distribuciones. Entre las más utilizadas por facilidad, estan: Ubuntu, Mandriva, Fedora, SuSe, etc. Te dejo un enlace donde podes ver muchas distribuciones y el top 25 de popularidad
OsDir.
Tercero, si queres que tu distribución de Linux, vea y modifique tus documentos de Windows, tendrías que formatear tu partición Windows en FAT32. En NTFS solo podrías ver o copiar la info de windows pero NO modificarla, aunque existen herramientas que lo hacen pero bajo tu propio riesgo.
Sobre el boot o inicio del PC, la mayoria o todas las distribuciones Linux te crean el menú donde te preguntan qué queres iniciar (Linux o Windows).